Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms