Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQE9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQE9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQE9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQE9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQE9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQE9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQE9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms