Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A3GALT2U3KPV4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms