Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC3Q9Y6N6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC3Q9Y6N6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms