Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNFRSF18Q9Y5U5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF18Q9Y5U5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms