Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDGFL3Q9Y3E1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms