Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGSF9BQ9UPX0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGSF9BQ9UPX0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms