Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNRGQ9UMZ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNRGQ9UMZ2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms