Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NRXN1Q9ULB1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NRXN1Q9ULB1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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