Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSL6Q9UKU0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms