Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPUSD1Q9UJJ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms