Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MBD1Q9UIS9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms