Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms