Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO40Q9UH90 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms