Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNAL1Q9UBT7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms