Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EXTL2Q9UBQ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms