Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK3Q9UBP4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK3Q9UBP4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK3Q9UBP4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK3Q9UBP4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DKK3Q9UBP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DKK3Q9UBP4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms