Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUCLA2Q9P2R7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUCLA2Q9P2R7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms