Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIPA1L2Q9P2F8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms