Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LRP1BQ9NZR2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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