Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDE1Q9NZC3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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