Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM260Q9NX78 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM260Q9NX78 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms