Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FANCLQ9NW38 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FANCLQ9NW38 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms