Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCAS3Q9H6U6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms