Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf49Q9H6J7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf49Q9H6J7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms