Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG9Q9H0W8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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