Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE41Q9C0J9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms