Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK-6Q9BXR3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-6Q9BXR3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms