Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HIRIP3Q9BW71 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
HIRIP3Q9BW71 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HIRIP3Q9BW71 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms