Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
FYCO1Q9BQS8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
FYCO1Q9BQS8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FYCO1Q9BQS8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms