Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1Q99536 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1Q99536 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1Q99536 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VAT1Q99536 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAT1Q99536 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAT1Q99536 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAT1Q99536 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAT1Q99536 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAT1Q99536 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms