Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YME1L1Q96TA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YME1L1Q96TA2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms