Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP2Q96SN8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms