Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
IFT140Q96RY7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT140Q96RY7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms