Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHF12Q96QT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms