Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC43Q96MW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms