Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP53Q96M91 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP53Q96M91 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms