Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C8orf48Q96LL4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C8orf48Q96LL4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms