Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHACTR3Q96KR7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHACTR3Q96KR7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms