Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNIP3Q96KP6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNIP3Q96KP6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms