Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS50Q96JG6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms