Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYFIP2Q96F07 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms