Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRRFQ96E11 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRRFQ96E11 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRRFQ96E11 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms