Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA4Q96DD7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms