Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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