Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC74AQ96AQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC74AQ96AQ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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