Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM58Q8NG06 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms