Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM35BQ8NCS4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM35BQ8NCS4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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