Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00301Q8NCQ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00301Q8NCQ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms