Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPRYD3Q8NCJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms